ชื่อ แซงต์เปาโล ตั้งตามชื่อนักบุญเปาโล เพื่อใช้เป็นชื่อวัดและโรงเรียนในคริสต์ศาสนาของคณะบาทหลวงเยซูอิตชาวฝรั่งเศส สถานที่แห่งนี้ไม่ได้เป็นเพียงศาสนสถาน แต่เป็นศูนย์กลางความรู้ที่สมเด็จพระนารายณ์มหาราชทรงอนุญาตให้สร้างขึ้นเพื่อเผยแผ่วิทยาการ ในเอกสารฝรั่งเศสโบราณมักระบุถึงที่นี่ในฐานะหอสังเกตการณ์ดาราศาสตร์ที่มีความทันสมัยที่สุดแห่งหนึ่งในเอเชียยุคคริสต์ศตวรรษที่ 17 คำว่า แซงต์เปาโล จึงเป็นสัญลักษณ์ของจุดเริ่มต้นการศึกษาดาราศาสตร์และคณิตศาสตร์สมัยใหม่ในประเทศไทยภายใต้ความสัมพันธ์ระหว่างประเทศ ปัจจุบันชื่อนี้ยังคงถูกใช้เรียกขานเพื่อระลึกถึงความร่วมมืออันยิ่งใหญ่ระหว่างราชสำนักสยามและนักวิทยาศาสตร์จากยุโรป