บ่อน้ำทิพย์ภายในถ้ำประทุนเป็นบ่อน้ำศักดิ์สิทธิ์ตามธรรมชาติที่ตั้งอยู่ภายในโถงถ้ำอันเงียบสงบ ซึ่งเชื่อกันว่าถูกค้นพบมาตั้งแต่สมัยกรุงศรีอยุธยาพร้อมกับการค้นพบรอยพระพุทธบาทสระบุรี โดยมีลักษณะเป็นน้ำที่ใสสะอาดและเย็นฉ่ำตลอดทั้งปีซึ่งชาวบ้านและพุทธศาสนิกชนมักเดินทางมาตักไปดื่มหรือประพรมร่างกายเพื่อความเป็นสิริมงคลตามความเชื่อโบราณ บรรยากาศรอบบ่อน้ำอบอวลไปด้วยควันธูปและความขลังจากการประดิษฐานรูปเคารพแบบจีนและพระเจดีย์ศิลาสมัยรัชกาลที่ 4 ทำให้ที่นี่เป็นจุดศูนย์รวมศรัทธาที่สำคัญภายในกุศลสถานถ้ำประทุน การได้สัมผัสน้ำทิพย์ท่ามกลางความสงบของหุบเขาและโถงถ้ำที่มีอากาศถ่ายเทสะดวกจึงช่วยประโลมจิตใจให้พบกับความร่มเย็นและพลังแห่งบุญกุศลอย่างแท้จริง