เขตพระราชฐานชั้นในเป็นพื้นที่หวงห้ามในสมัยโบราณ เป็นที่ประทับส่วนพระองค์ของสมเด็จพระนารายณ์มหาราชและสตรีในราชสำนัก สิ่งก่อสร้างที่สำคัญที่สุดในเขตนี้คือพระที่นั่งสุทธาสวรรย์ ซึ่งเป็นที่ประทับส่วนพระองค์ของพระมหากษัตริย์และเป็นสถานที่เสด็จสวรรคต บริเวณโดยรอบเคยได้รับการตกแต่งอย่างสวยงามด้วยสวนดอกไม้ ไม้ประดับ และน้ำพุ โดยได้รับอิทธิพลจากสถาปัตยกรรมฝรั่งเศสที่พระองค์ทรงชื่นชม ลักษณะสำคัญของเขตนี้คือความเงียบสงบและการจัดวางที่เน้นความเป็นส่วนตัว โดยมีกำแพงและทางเข้าออกที่แยกจากเขตพระราชฐานชั้นกลางอย่างเคร่งครัด ปัจจุบันยังคงมีซากฐานรากอาคารและกำแพงหลงเหลืออยู่ แสดงให้เห็นถึงความยิ่งใหญ่และวิถีชีวิตของราชสำนักลพบุรีเมื่อกว่า 300 ปีที่แล้ว