พระบรมธาตุเจดีย์ หรือที่เรียกกันในท้องถิ่นว่า "พระบรมธาตุทันใจ" เป็นองค์เจดีย์ประธานที่ประดิษฐานอยู่ด้านหลังวิหารหลวง ณ วัดพระเจ้าทันใจ องค์เจดีย์มีลักษณะเป็น เจดีย์ทรงระฆังคว่ำศิลปะล้านนา ฐานสูงซ้อนชั้นหุ้มด้วยแผ่นทองเหลืองฉลุลาย (จังโก) อย่างวิจิตรบรรจง ภายในองค์พระธาตุบรรจุ พระบรมสารีริกธาตุ (ในบางตำนานระบุว่าบรรจุพระเกศาธาตุและพระอัฐิธาตุ) สื่อถึงสัญลักษณ์แห่งศูนย์กลางความศรัทธาของชุมชนบ้านต้นธงชัยมาอย่างยาวนาน โดยมีความเชื่อเชื่อมโยงกับ "พระเจ้าทันใจ" ว่าผู้ที่มาสักการะองค์พระธาตุพร้อมกับพระเจ้าทันใจจะได้รับอานิสงส์ให้สิ่งที่ปรารถนาสำเร็จผลได้อย่างรวดเร็ว