ท่าเรือหลักของคลองลัดมะยมตั้งอยู่ในโซน 1 และโซน 2 เป็นศูนย์กลางของเรือพายแบบดั้งเดิมและเรือหางยาว จุดจอดเรือขนาดเล็กกว่าจะอยู่ใต้สะพานไม้ที่เชื่อมต่อโซนต่างๆ เพื่อให้เรือนำเที่ยวสามารถรับส่งผู้เข้าชมได้ นอกจากนี้ยังมีจุดจอดเรือเฉพาะสำหรับผู้ขายที่พายเรือมาขายผลิตผลสดใหม่และของว่างท้องถิ่นให้กับนักช้อปริมฝั่งโดยตรง ค่าโดยสารเรือเที่ยวชมเริ่มต้นเพียง 60 บาทต่อคน หรือคุณสามารถเลือกเช่าเหมาลำส่วนตัวเพื่อความสะดวกสบายยิ่งขึ้นและโอกาสในการถ่ายภาพที่ดีกว่า